حجتالاسلام سیداحمد خمینی فرزند روحالله در سال 1324 شمسی در شهر قم دیده به جهان گشود. پس از پایان تحصیلات متوسطه به توصیه پدر به حوزه علمیه قم راه یافت و در محضر اساتیدی چون حضرات آیات: سلطانی، فاضل ابطحی دروس مختلف را فرا گرفت و سپس تحصیلات خود را در محضر پدر و برادرش آیتالله حاج سیدمصطفی و آیتالله شیخ مرتضی حائری ادامه داد.
پس از تبعید امام و آیتالله سیدمصطفی خمینی به ترکیه در سال 1343 او در ایران باقی میماند و به مبارزه مشغول بود تا آن که در سال 1344 مخفیانه برای دیدن پدر و برادر خود به نجف اشرف رفت و پنج ماه بعد به ایران آمد اما در راه بازگشت، دستگیر و زندانی شد. پس از آزادی بار دیگر در سال 1345 به دیدار پدر شتافت و این بار به ملبس به لباس روحانیت به ایران آمد و به تدریس در حوزه مشغول شد.
سیداحمد تا سال 1356 در قم فعالیت مبارزاتی علیه رژیم پهلوی پرداخت. در همین سال به نجف اشراف رفت و در کنار پدر و برادر خود به مبارزه ادامه داد. با شهادت مصطفی، بار گران همراهی با پدر بر دوش او قرار گرفت.
پس از پیروزی انقلاب گرچه سمت رسمی در هیچ نهادی نداشت اما در بسیاری از صحنهها حضور داشت. در این مورد آیتالله رفسنجانی در خاطرات خود به موارد بسیار اشاره کرده است.
حجتالاسلام سیداحمد خمینی سرانجام در سال 1374 درگذشت و در کنار مزار پدر آرام گرفت.