نایب رئیس فراکسیون اصولگرایان مجلس در عین رد این امر که یک عده خود را منحصراً طرفدار دولت بدانند و بقیه را از این دایره بیرون کنند، یادآور شد: فراکسیون اصولگرایان معتقد است که بهارستان نباید دنبال پاستور بدود. محمد رضا باهنر در گفتگو با ایسنا، در ارزیابی از عملکرد یک سال گذشته فراکسیون متبوعش گفت: حدود 220 نفر از نمایندگان در این فراکسیون اسم نوشته اند و به همین دلیل نیز طیف های وسیعی در این فراکسیون عضویت دارند و اساس شرط عضویت در این فراکسیون، اعتقاد به نظام جمهوری اسلامی، قانون اساسی، ولایت فقیه و مبانی اسلام و شر ع است. وی با بیان این که عملادر زیرمجموعه فراکسیون اصولگرایان، سه فراکسیون خرد قرار دارد و در اساسنامه فراکسیون، مجوز این کار داده شده است، افزود: شرط این امر آن است که این فراکسیون های خرد باید در مواقعی که فراکسیون اصولگرایان به طور کلی تصمیم می گیرد، خود را با فراکسیون اصلی هماهنگ کنند و در غیر این صورت می توانند مواضع مستقل خود را داشته باشند و کار کنند. نایب رئیس مجلس ادامه داد: بحثی مطرح بود مبنی بر این که چون تعداد اعضای فراکسیون زیاد است و گرایشات متفاوتی نیز در آن حضور دارند، فقط تلاش کنند که در مسائل کاملامهم و برتر که اجماع و وحدت وجود دارد، موضع گیری کنند و وارد بحث های تخصصی، کارشناسی و لوایح و طرح های معمولی نشوند،زیرا در این موارد، اختلاف نظرات کارشناسی در ابعاد اقتصادی، سیاسی و فرهنگی وجود دارد.
به گفته باهنر، یک گروه تاکید داشتند که فراکسیون اصولگرایان حساس باشد و روی بسیاری از مسائلی که در جامعه اتفاق می افتد، موضع گیری کند، اما مخالفان این نظر، معتقد بودند که این اعلام مواضع متعدد ممکن است باعث شود که اختلافات داخلی فراکسیون که طبیعی نیز می باشد، فضای کلی هماهنگی و وحدت فراکسیون را مخدوش کند. این عضو هیئت رئیسه فراکسیون اصولگرایان تصریح کرد: در مجموع، فراکسیون در طول سال گذشته، تلاش خود را پیرامون این وحدت انجام داد. البته طیف های تندرویی در هر دو طرف فراکسیون وجود داشتند که برخی از آنها که تعدادشان محدود بود، معتقد بودند که باید با همه توان و بدون شرط از همه رفتارهای دولت حمایت کرد، در سوی دیگر نیز نظر برخی دیگر از اعضای فراکسیون وجود داشت که عمدتا منتقد رفتارهای دولت بودند و ما به عنوان هیئت رئیسه فراکسیون سعی کردیم که نظریه وحدت گرا را در فراکسیون اعمال کنیم و بر مسائلی که به آن وحدت نظر وجود دارد، تمرکز کنیم. وی با بیان این که نظریه ای در درون فراکسیون مبنی بر این که "آیا یکی بودن رئیس مجلس با رئیس فراکسیون بهتر است یا خیر؟" وجود داشت، خاطرنشان کرد: این نظریه در اول دوره مطرح بود و در شورای مرکزی مورد بحث قرار گرفت و تفاهم شد که رئیس مجلس بتواند رئیس فراکسیون باشد و این نظر رای بالایی را به خود اختصاص داد، اما در طول یکسال، بعضا بعضی از دوستانی که خیلی قانع نبودند و یا از ریاست رئیس مجلس بر فراکسیون راضی نبودند، این مسئله را مرتب تکرار کردند و این انتخابات اخیر هم باعث شد که مجددا این مسئله، در شورای مرکزی به رای گذاشته شود و البته دیدیم که رئیس مجلس با رای بسیار خوب و بالایی رئیس فراکسیون شد.
باهنر همچنین در خصوص احتمال تغییر اساسنامه فراکسیون برای یکی نبودن ریاست فراکسیون و ریاست مجلس با بیان این که تغییرات اساسنامه فراکسیون را باید دوسوم اعضای مجمع تصویب کنند، گفت: اشکالی ندارد، فقط نظرات نباید سیاسی شود، یعنی اگر به واقع اکثریت فراکسیون به این جمع بندی برسد که مصلحت نیست که رئیس مجلس، رئیس فراکسیون باشد. قابل بررسی است، اما در فضای انتخابات فراکسیون، تعداد معدودی بودند که می خواستند این مسئله را بهانه ای برای تغییر هیئت رئیسه فراکسیون قرار دهند و در این راستا تلاش هم کردند. همچنین به گزارش ایلنا، محمدرضا باهنر در پاسخ به سوالی که <به احتمال خروج برخی اعضای فراکسیون انقلاب اسلامی از فراکسیون اصولگرایان> اشاره داشت، گفت: ما تلاش می کنیم که اینگونه نشود. باهنر با تاکید بر اینکه تلاش می کنیم در حد معقول رعایت همه را در فراکسیون اصولگرایان بکنیم، خاطرنشان کرد: اگر کسانی بخواهند کل مواضع فراکسیون را مختص خودشان بکنند، صحیح نیست و نمی توان آن را پذیرفت.