علی لاریجانی رئیس مجلس قبل از هرگونه اقدام کمیسیون تلفیق بودجه، برای جلوگیری از اختلافات بیشتر نمایندگان مجلس و اعضای کمیسیون ها، پادرمیانی کرد و پیش از آغاز به کار این کمیسیون بر تفاهم بین مجلس و دولت در تصویب لایحه بودجه 88 و واقعی شدن آن تاکید کرد.
عزت الله یوسفیان نماینده آمل با اشاره به حضور لاریجانی در نخستین روز جلسه کاری کمیسیون تلفیق گفت: «رئیس مجلس در حالی بر تفاهم بین نمایندگان مجلس و دولتمردان در بررسی و تصویب لایحه بودجه 88 تاکید کرد که بودجه 88 خوب، قابل دفاع و واقعی باشد؛ بودجه ای که قابلیت اجرایی داشته باشد.»به گزارش ایسنا، یوسفیان در ادامه، بررسی آثار و ایرادات بودجه 87 را از دیگر موضوعات مورد تاکید کمیسیون تلفیق دانست و خاطرنشان کرد: «تاکید اعضای تلفیق این بود که اشکالات و ایرادات بودجه 87 مجدداً در لایحه بودجه 88 تکرار نشود.»
تاکید علی لاریجانی رئیس مجلس درخصوص تفاهم بین مجلس و دولت در تصویب لایحه بودجه 88 در حالی مطرح می شود که پیش از این رئیس مجلس در سخنرانی های مختلف خود با اشاره به اینکه مطالبه مقام معظم رهبری از دولت، مجلس و قوه قضائیه درخصوص اجرای اصل 44 واقعی است، گفته بود: «اگر دولت برنامه ای برای کشور دارد باید در چارچوب سیاست های اصل 44 باشد و اگر دولت می خواهد بودجه سال آینده را تنظیم کند باید در چارچوب همین سیاست ها باشد. همچنین مجلس باید در کارهای خود به سیاست های اصل 44 قانون اساسی توجه داشته باشد و اینجانب به کمیسیون های تخصصی مجلس تاکید کرده ام که اولویت کار خود را توجه به این سیاست ها قرار دهند.»
وی پس از تقدیم لایحه بودجه از سوی دولت به مجلس گفته بود: «اگر سیاست های اصل 44 اجرا می شد امروز ما با کسری بودجه مواجه نبودیم و...»
تاکید رئیس مجلس بر اجراشدن اصل 44 از سوی دولت از یک سو و هشدارهای محمدرضا باهنر نایب رئیس دوم مجلس و از چهره های شاخص اصولگرایان خطاب به دولت، نشان از چالش دولت و مجلس دارد. چنانچه باهنر خطاب به دولت هشدار داده بود منتظر بررسی لایحه هدفمند کرده یارانه ها در مجلس نباشند و سریع تر لایحه بودجه 88 را تقدیم مجلس کنند.
این هشدارهای باهنر به دولت سرانجام به شکسته شدن سکوت غلامحسین الهام سخنگوی دولت انجامید و وی اعلام کرد بالاخره اوایل بهمن ماه لایحه بودجه 88 به مجلس خواهد رسید.هرچند اعضای هیات رئیسه مجلس در سخنان و هشدارهای خود خطاب به دولت همواره تلاش می کردند بحث لایحه هدفمندکردن یارانه ها را از لایحه بودجه 88 جداکرده و به موازات یکدیگر، نمایندگان به بررسی هر دو لایحه در کمیسیون های تخصصی خود بپردازند اما در سخنان محمود احمدی نژاد رئیس جمهوری همواره تاکید بر لایحه هدفمندکردن یارانه ها بر بودجه سال آینده برتری داشته است. چنانچه وی پس از تقدیم بودجه 88 به مجلس در جمع خبرنگاران حاضر شد و در پاسخ به پرسشی درباره اصلاحات مجلس در مورد لایحه هدفمندکردن یارانه ها و برخی حذف ها گفت: «قانون را مجلس می نویسد، ما لایحه را به مجلس داده ایم و آنچه از مجلس به عنوان قانون خارج شود، لازم الاجراست.»
سپس وی سیاست های کلی اصل 44 و طرح هدفمندکردن یارانه ها در بودجه 88 را دو ویژگی مهم بودجه سال بعد خواند و اظهار داشت: «لایحه بودجه سال 88 را به گونه ای تدوین کرده ایم که پس از تصویب لایحه هدفمندکردن یارانه ها در مجلس نیازی به اصلاح دوباره آن نباشد و تمام پیش بینی های لازم را در این باره انجام داده ایم.»اما پس از تقدیم بودجه 88 از سوی دولت به مجلس، نه تنها از اختلافات بین دولت و مجلس کاسته نشد بلکه برخی از نمایندگان مجلس مبادرت به مطرح کردن برخی اشکالات به ویژه درباره ماده 9 لایحه هدفمندکردن یارانه ها کردند که یکی از مهم ترین اختلافات بین دولت و مجلس است.
در ماده 9 لایحه هدفمندکردن یارانه ها آمده است رئیس جمهور (یا معاون اول وی) به عنوان رئیس و وزیر امور اقتصادی و دارایی، وزیر رفاه و تامین اجتماعی و معاون برنامه ریزی و نظارت راهبردی رئیس جمهور می توانند صندوق غیردولتی و مستقل لایحه هدفمندکردن یارانه ها را اداره کنند و دو نفر از نمایندگان مجلس نیز می توانند بر آن نظارت داشته باشند.
یکی دیگر از موارد چالش مجلس و دولت درباره چگونگی مصوبات مجلس در بودجه توسط دولت است چنانچه محمدرضا خباز نماینده کاشمر در تذکر آیین نامه ای خطاب به محمدرضا باهنر نایب رئیس دوم مجلس که به جای علی لاریجانی نشسته بود، گفت: «گزارش کمیسیون برنامه و بودجه نشان می دهد دولت به جای اجرای مصوبه مجلس تنها به اجرای همان 36 ردیف مصوبه خود پرداخته و 262 ردیف مجلس را اجرا نکرده است و ما نمایندگان برای بررسی بودجه سال 88 به ضمانت اجرایی نیاز داریم و...»از این روست که رئیس مجلس این بار پیش از هر تصمیمی از سوی مجلس درباره بودجه به نمایندگان سفارش می کند تفاهم با دولت در دستور کار باشد. شاید. این توصیه در آخرین سال دولت نهم کمکی به چالش های فزاینده این دو نهاد تاثیرگذار کند.