این دوران جدید که از آن می توان به دوران تثبیت نظام اسلامی یاد کرد دارای ویژگی هایی است که به طور خلاصه بدان اشاره میکنیم:
1- اولین شاخصه آن اینکه پس از سه سال بحران های متعدد، تمامی نهادهای انقلاب روند تکمیلی خود را طی کرده و علیرغم توطئه ها، آشوب ها، کودتاها و فتنه های ضدانقلاب روند تاسیس جمهوری اسلامی مطابق قانون اساسی به پیش رفت. دستگاه اجرایی با ریاست جمهوری و حضرت آیت الله خامنه ای، مجلس با نمایندگان مردم و به ریاست آقای هاشمی رفسنجانی، شورای نگهبان باترکیب فقها و حقوقدان ها، دستگاه قضایی به شکل شورای عالی قضایی مطابق قانون اساسی دولت با نخست وزیری میرحسین موسوی، ارتش و نیروهای مسلح و تمامی نهادهای انقلابی دیگر همچون کمیته های انقلاب، سپاه پاسداران، جهاد سازندگی در موضع قدرت و ثبات قرار گرفته بودند.
در این شرایط حضرت امام پیام مهمی به مناسبت سومین سالگرد رسمیت یافتن جمهوری اسلامی در پنج بند صادر می کنند و در بند پنجم آن مرقوم می دارند: «امروز دنیا، حتی کوردلان هم می دانند که ایران از موضع قدرت که موهبت الهی است صحبت می کند. امروز ایران به آن حرفی که از روز اول گفته است پای بند است.»
2- دومین مورد که می توان به عنوان نشانه ای از دوران تثبیت ذکر کرد اینکه ضریب امنیتی در تمام سطوح جامعه رو به افزایش بود و نیروهای امنیتی انقلاب پس از یک سال درگیری های خونین به کشمکش ها پایان داده بودند و هر یک از ارگان ها جایگاه سازمانی و ماموریتی خود را به دست آورده و روال عادی جاری و ساری شده بود. حتی شورای تامین امنیت شهرها تصویب نمود که تمام سنگرهای خیابانی بر سر چهارراه ها، ایست و بازرسی ها و سرعت گیر ماشینها جمعآوری گردد.
3- حضرت امام نیز در آذرماه سال 61 فرمان هشت ماده ای را خطاب به قوه قضاییه و تمام ارگان های اجرایی در مورد اسلامی شدن قوانین و عملکرد ها صادر نمودند که در بند سوم آن آمده است: «آقایان قضات واجد شرایط اسلامی چه در دادگستری و چه در دادگاه های انقلاب باید با استقلال و قدرت بدون ملاحظه از مقامی احکام اسلام را صادر کنند و در سراسر کشور بدون مسامحه و تعویق به کار پر اهمیت خود ادامه دهند و مامورین ابلاغ و اجرا و دیگر مربوطین به این امر باید از احکام آنان تبعیت نمایند تا ملت از صحت قضا و ابلاغ و اجرا و احضار احساس آرامش قضایی نمایند و احساس کنند که در سایه احکام عدل اسلامی جان و مال و حیثیت آنان در امان است و عمل به عدل اسلامی مخصوص قوه قضاییه و متعلقات آن نیست که در سایر ارگان های نظام جمهوری اسلامی از مجلس و دولت و متعلقات آن و قوای نظامی و انتظامی و سپاه پاسداران و کمیته ها و بسیج و دیگر متصدیان امور نیز به طور جدی مطرح است و احدی حق ندارد با مردم رفتار غیراسلامی داشته باشد...»
این پیام در استقرار نظم، آرامش، امنیت در زندگی مردم نقش تعیین کننده ای داشت و ضریب امنیت را در سراسر کشور افزایش داد.
4- فتح و پیروزی های بزرگ در روند تحول جنگ دستاوردهای فراوانی را برای نظام جمهوری اسلامی به ارمغان آورد و در عرصه سیاست خارجی و بین المللی موقعیت ایران را در شرایط برتری قرار داده و پیام استحکام و پایداری نظام جمهوری اسلامی را به جهانیان رسانید. در این حین دولتمردان در زمینه های مختلف در مذاکرات و انعقاد قراردادها با دست برتر و موضع انقلابی وارد گفتگو می شدند و کشور در مسیر کارهای عمرانی و سازندگی نسبت به گذشته بسیار فعالتر می گردید و در یک کلام دنیا به ایران به چشم یک دولت قدرتمند و تثبیت شده مینگریست.
5- مورد دیگر از نشانه های تثبیت در آذرماه سال 61 برگزاری اولین دوره انتخابات مجلس خبرگان بود که در آن هیجده میلیون نفر از واجدین شرایط شرکت کردند. این مجلس آخرین نهاد تاسیسی بود که ایجاد گردید و نگرانی های پس از رحلت امام را هم برطرف کرد. این اقدام موجب سرخوردگی تمام مخالفان نظام جمهوری اسلامی شد و امید آنها برای براندازی به یاس تبدیل شد و در داخل کشور نوید تداوم و ثبات نظام اسلامی را به همراه داشت.