امام(ره) همواره از مردم می‌خواستند که تحت تأثیر تبلیغات رسانه‌های بیگانه قرار نگیرند و طبق موازین اسلامی نمایندگان خود را انتخاب کنند و می‌فرمودند: «کسانی را انتخاب کنید که صد درصد مسلمان و معتقد به احکام اسلام و متعهد به اجرای احکام اسلام و مخالف با مکتب‌های انحرافی و معتقد به جمهوری اسلامی باشند.» با وجود تذکرات حضرت امام(ره) باز هم اختلافات تکرار می‌شد؛ برای نمونه، مهندس مهدی بازرگان که در مرحله اول از حوزه انتخابیه تهران به مجلس راه یافته بود، طی اعلامیه‌ای، حمایت خود را از گروه مجاهدین خلق اعلام کرد. پس از این موضع‌گیری مخالفت‌ها با وی شدت گرفت که قسمت عمده این مخالفت‌ها از سوی جریان اسلامی بود.