یک نهاد امنیتى در گزارشى درباره پرونده حسین موسویان، معاون مرکز تحقیقات استراتژیک مجمع تشخیص مصلحت نظام آورده: برخلاف شیوه هاى معمول سازمان هاى جاسوسى دنیا، موسویان داراى کد کلاسیک نبوده و قرارهاى مشخصى جهت انتقال اطلاعات نداشته، لذا با توجه به این موضوع و براساس قوانین موجود، مجازات سنگینى متوجه وى نبوده است.بر اساس این گزارش، البته موسویان در یکى از مکالمات تلفنى خود به نوعى بر تسریع طرف غربى بر صدور قطعنامه در سازمان ملل تأکید کرده و لذا اتهام اقدام علیه امنیت ملى متوجه وى خواهد بود.در ادامه گزارش آمده: ماجراى دستگیرى موسویان از این قرار بوده که وى در سال گذشته ۵۰ روز مسافرت خارج از کشور داشته و ملاقات هاى زیادى با افراد تحت پوشش طرف هاى اروپایى و دیپلمات هاى غربى داشته که برخى از آنان به طور قطع از افراد سرویس هاى امنیتى غرب بوده اند و با این حال موسویان به راحتى با آنها صحبت کرده.بنابراین گزارش، از جمله اتهام هاى دیگر معاون دکترحسن روحانى این بوده که یک سرى اسناد محرمانه در اختیار وى بوده که باید آنها را تحویل مقام هاى مربوطه مى داده، ولى این کار را نکرده و آنها را تحویل نداده است.مهمترین اتهام موسویان هم درباره یک سرى اسنادى بوده است که در نهایت به دست سرویس امنیتى MI6 انگلیس افتاده بوده است..