در پی اطلاع از نتایج تحقیقات ستادکل نیروهای مسلح درباره سقوط هواپیمای مسافربری اوکراینی، حضرت آیت‌الله‌العظمی خامنه‌ای، رهبر معظم انقلاب اسلامی با صدور پیامی ضمن ابراز همدردی عمیق و مجدد با خانواده‌های داغدار، ستادکل نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران را مأمور پیگیری کوتاهی‌ها یا تقصیرهای احتمالی در این حادثه و مراقبت برای عدم امکان تکرار چنین سانحه‌ای کردند. متن پیام رهبر معظم انقلاب به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
با اطلاع از نتایج تحقیقات ستادکل درباره حادثه هواپیمای مسافربری اوکراینی و اثبات دخالت خطای انسانی در آن، مصیبت درگذشت جان‌باختگان این حادثه اندوهبار برای اینجانب بسیار سنگین‌تر شد. لازم می‌دانم اولاً به خانواده‌های معظم این عزیزان بار دیگر همدردی عمیق و تسلیت صمیمانه خود را ابراز کنم و از خداوند متعال برای آنان بردباری و آرامش روحی و قلبی تمنا نمایم. ثانیاً به ستادکل نیروهای مسلح مؤکداً درباره پیگیری کوتاهی‌ها یا تقصیرهای احتمالی در این حادثه دردناک سفارش کنم. ثالثاً مراقبت و پیگیری‌های لازم برای عدم امکان تکرار چنین سانحه‌ای را از مدیران و مقامات ذی‌ربط مطالبه نمایم. پروردگار عزیز و کریم به درگذشتگان لطف و رحمت و به داغداران صبر و اجر عنایت فرماید.
سیّدعلی خامنه‌ای، 21 دی 1398